J9九游会
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表观遗传多组学
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DNA甲基化+转录组(RNA-seq)
联合转录组(RNA-seq)，可以了解样本中DNA甲基化修饰和RNA表达是否存在整体上的相关性、样本中哪些基因的转录表达受到DNA甲基化修饰的影响的基因及功能。 -
RNA甲基化(m6A修饰)+转录组(RNA-seq)
在进行m6A相关研究时结合转录组(RNA-seq)，进一步挖掘RNA甲基化酶靶基因，探究转录本修饰水平与基因表达水平的相关性。
染色质微环境多组学
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ATAC-seq+转录组(RNA-seq)
将ATAC与转录组(RNA-seq)关联分析，可以研究ATAC信号反映的染色质开放性程度与基因表达调控的机制，评估用染色质开放性阐述转录水平乃 至下游表型变化的可信度。 -
CUT&Tag+ATAC-seq+转录组(RNA-seq)
CUT&Tag与ATAC-seq以及转录组(RNA-seq)联合分析，可以探究组蛋白标记调控和染色质开放性的一致相关性，探究转录因子调控转录起始的过程，以及完善染色质微环境调控基因表达的调控网络。 -
Hi-C+转录组(RNA-seq)
整合Hi-C与转录组(RNA-seq)数据，用以研究染色体结构变化与基因表达调控之间的关系，从基因组、转录组两种组学结合的视角阐述生物体性状形成的相关机制。
染色质微环境多组学
一对一项目服务，科学的方案设计，严格的质控管理，专业的分析团队，丰富的项目经验，优质的项目服务，确保每一个环节都能出色完成，同时还搭建各组学联合分析流程，全面助力客户科学研究及发表文章进军高分文章。多组学送样建议
| DNA甲基化 | 取样标准 | 表观遗传学具有显著的组织特异性，不同组织细胞间甲基化状态可能会有巨大差异，重点需要参考老师的研究课题进行取样 |
|---|---|---|
| 测序深度 | 全基因组甲基化测序，测序深度建议 30×/ 样 | |
| RNA甲基化 (m6A修饰 ) | 取样标准 | 取样时间、部位、环境等尽量保持一致，不同类型的样本可能会存在一定差异，针对具体研究部位进行取样 |
| ATAC-seq | 取样标准 | 取样过程中，尽可能减少人为造成的样品间差异，且确保自己的样本没有外源污染 |
| CUT&Tag/ChIP-seq | 取样标准 | 采集的样本应该通过严格的细胞学、组织学、病理学等相关鉴定，且确保自己的样本没有外源污染 |
| Hi-C | 取样标准 | 微小个体生物，建议选择相对近源的物种进行混样，混样个体切忌太多；含水量极高的样本，建议客户多准备一些样本，选择底部细胞沉淀进行实验；辅助组装样本尽可能保持与基因组样本来自同 一个体 ( 或相对近源的个体 ) |
| 注：各组学样本分装保存并寄送 | ||
信息分析内容 ( 单组学 )
| DNA甲基化 | RNA甲基化 | ATAC-seq | CUT&Tag/ChIP-seq | Hi-C |
|---|---|---|---|---|
| 甲基化位点检测 | 结合位点检测(peak calling) | 互作图谱构建 | ||
| 单样本甲基化分析 | Motif分析 | 差异互作图谱分析 | ||
| 功能区域甲基化水平分布 | 基因功能区peak分布 | A/B compartments分析 | ||
| 差异甲基化区域分析 | 差异分析 | TAD分析 | ||
信息分析内容 ( 多组学 )
| DNA甲基化 | RNA甲基化(m6A 修饰 ) | ATAC-seq | CUT&Tag/ChIP-seq | Hi-C |
|---|---|---|---|---|
| 与RNA-seq联合分析 | ||||
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