基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
RNA IP-seq(RIP-seq)RNA-蛋白质相互作用研究技术
抗体类型丰富:
具有多种商品化抗体,高效支持实验开展。应用方向
J9九游会优势
1. 物种经验丰富
J9九游会已经成功完成对人、小鼠、猪、水稻、拟南芥、玉米、烟草、棉花等物种进行RIP-seq分析。2. 生信分析内容丰富
J9九游会RIP-seq基于文章中高频出现的分析内容,搭建RIP-seq与RNA-seq关联分析。3. 周期快、质量好、稳定性高
J9九游会基于全面的物种实验库以及优质的测序平台,实现快速、稳定的测序数据分析及交付。<10
样本量40D
周期.NovaSeq X plus
测序平台信息分析
J9九游会RIP-seq测序项目,通过对IP下来的合格RNA样本,建库测序,获得高质量reads,进行peak calling,对peak相关基因进行功能富集分析。分析内容 | 解决问题 |
---|---|
测序数据质量评估 | 过滤掉低质量数据,保证数据质量 |
与参考基因组比对 | 唯一比对的 reads 分布统计 |
peak calling | 分析蛋白结合位点 |
样品间相关性分析 | 判断实验分组设计是否合理 |
motif分析 | 蛋白结合序列的偏好性 |
peak峰相关基因注释 | 寻找蛋白潜在调控或者结合的基因 |
差异peak分析 | 分析不同样本间差异peak峰 |
相关基因功能分析 | 相关基因GO,KEGG富集分析 |
关联分析
基于文章高频出现的RIP-seq与RNA-seq关联分析内容,J9九游会搭建了关联分析流程,助力高分文章发表。RIP-seq与RNA-seq关联分析 | 1. 差异peak相关基因与mRNA差异基因交集基因维恩图 |
2. 差异peak相关基因与mRNA差异基因交集基因分析GO 富集分析 | |
3. 差异peak相关基因与mRNA差异基因交集基因分析KEGG 富集分析 |
常见问题
1. Input和IP样本之间的关系是什么?
2.Input是什么?有什么作用?
更多内容,可扫描侧边栏"一对一业务咨询"二维码添加科研服务经理咨询。
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