基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
16S/18S/ITS等扩增子测序(三代)
一次分析多个高变区信息,还原真实微生物群落结构
应用方向
细菌多样性研究:16S全长J9九游会优势
1. 一次性获得全部变异区序列信息,种级别物种注释率高
不同来源样本二代与三代扩增子注释到种级别的占比样本类型 | 二代种水平比例 | 三代种水平比例 |
---|---|---|
土壤 | 10%-20% | 60%-70% |
人粪便 | 20%-30% | 60%-70% |
口腔拭子 | 15%-20% | 60%-70% |
动物粪便 | 10%-20% | 60%-70% |
2. 周期短,质量好
基于Pacbio长度长测序平台,并与高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)结合,实现快速、稳定的测序数据分析及交付。全长扩增子建库-测序-分析,仅需30天20,280个
物理核数1,727 T flops
计算峰值速度400 TB
总内存58.6PB
总储存3. 分析流程严格,方案设计专业
J9九游会全长扩增子具有更为严格的分析流程,从质控到分析,“步步为营”,“精心布阵”,为您的paper保驾护航!60人
分析团队7年
项目经验5000+
结题项目1对1
项目服务信息分析
J9九游会基于测序得到的序列,进行 OTU 聚类和物种注释分析,获得物种的丰度分布,从而全面分析样本内物种的丰富度及组间差异。标准分析 | 解决问题 |
---|---|
物种注释 | 物种注释及各物种丰度信息 |
α- 多样性分析 | 微生物群落的丰富度和多样性 |
β- 多样性分析 | 不同样本间的微生物群落及各样本差异情况 |
多元统计分析 |
寻找组间具有显著差异的物种,同时可以比较组内差异和组间差异的大小,判断分组 是否有意义。 |
CCA 分析 | 研究物种组成与环境因子的关系 |
环境因子关联分析 | |
VPA 分析 |
送样建议
样本类型 | 建议送样量 | 最低送样量 |
---|---|---|
土壤/污泥/沉积物/腐殖质 | 3-5g | 1g |
水体滤膜 (孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm) | 2-3 张 | 1张 |
拭子 | 3-5 个 | 1 个 |
瘤胃液/发酵液/组织液 (离心有明显沉淀) | 3-5mL | 1mL |
粪便/肠道内容物 | 3-5g | 1g |
动物/人组织 | 1-3g | 1g |
血浆 | 3-5mL | 1mL |
常见问题
1. 三代扩增子有什么优势?
三代扩增子可以获得更准确的物种注释结果,一次实现多个高变区的扩增和测序,种水平注释结果可信度更高。
2. 样本送到公司,什么时候可以拿到结果?
三代扩增子可以获得更准确的物种注释结果,一次实现多个高变区的扩增和测序,种水平注释结果可信度更高。自样本检测合格之后开始计算周期,包括建库、测序、数据分析、结题。全长扩增子周期共计30个自然日。
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