基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
变异检测—探索遗传变异,解密生命本质
变异检测是指通过高通量测序技术对某一物种个体或群体的基因组进行测序及差异分析,获得大量的遗传变异信息,如单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失(InDel)、结构变异(SV)、拷贝数变异(CNV) 等用于开发分子标记建立遗传多态性数据库,为后续揭示进化关系、挖掘功能基因等奠定数据基础。J9九游会优势
1. 周期短,密度高,检测全面。
基于全基因组重测序的变异检测研究具有“周期短、密度高、检测全面”等优势,可用于开发分子标记,建立遗传多态性数据库,为探讨进化关系,挖掘性状基因,分子辅助育种等奠定基础。40天+
项目周期≥90%
验证率ALL
检测类型2.长读长测序,针对SV检测,轻松跨过复杂区域
基于三代长读长测序的SV变异检测,无GC偏好,轻松跨过高重复和高复杂区域,检测SV类型全面,发现更多NGS或TRS检测不到的新SV,更广泛尺度上解析遗传变异。90天+
项目周期10 kb起
测序读长SV
检测类型3.科学的方案设计
从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。材料选取
DNA样品
二代≥1.0μg
三代≥10μg
文库构建
二代350bp
三代≥10kb
测序
二代Illumina PE150
三代Pacbio或Nanopore
信息分析
4.丰富的项目经验
J9九游会已成功对猪、鼠、虎、蜜蜂等动物,玉米、水稻、油菜、棉花等植物,多达几百个物种进行变异检测。“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,完善的项目服务” 确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。50人
分析团队5年
项目经验600+
结题项目1对1
项目服务信息分析
通过全基因组重测序(WGS)开展变异检测研究,可保证变异信息全面且准确性高;对于一些无参物种的变异检测研究,则需采用简化基因组测序(GBS或RAD)技术。此外,通过三代变异检测,检测长片段序列,分析基因组结构变异。三代数据检测 SV 结合二代数据检测 SNP、InDel,可覆盖物种全部变异信息。三代变异检测 | 全基因组重测序(WGS) | 简化基因组测序(GBS) | 简化基因组测序(RAD) | ||
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Pacbio/Nanopore≥15X | SNP/InDel≥10X SV≥20X、CNV≥30X |
Tag数≥10万 平均8X/Tag |
测序深度≥1× | ||
有参考基因组 | 有参考基因组 | 有参考基因组 | 无参考基因组 | 有参考基因组 | 无参考基因组 |
测序数据质量评估 | 测序数据质量评估 | 测序数据质量评估 | 测序数据质量评估 | ||
与参考基因组比对 | 与参考基因组比对 | 与参考基因组比对 | GBS Tag聚类 | 与参考基因组比对 | RAD Tag聚类 |
SV检测、注释及统计 | SNP、InDel、SV、CNV 检测、注释及统计 |
SNP检测、注释及统计 | SNP检测、注释及统计 |
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