基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
circRNA的鉴定
使用主流软件通过位点识别鉴定circRNA转录本,并分析circRNA来源于exon或intron的剪接。如果样品的物种存在于 circBase 中,则将所有鉴定的 circRNA 与已知 circRNA 比较,统计测序结果中已知 circRNA 的数量及比例。circRNA表达水平分析
对各样本中已知circRNA和新circRNA进行表达量的统计,用TPM进行表达量归一化处理。可通过TPM密度分布能整体检查样品的基因表达模式。通过整体的基因表达模式能够初步推断样本之间的相似性。circRNA差异表达分析
根据各样本中circRNA的read count值对样本间的差异表达circRNA进行分析,根据有无生物学重复可选用DESeq或DEGseq软件。差异circRNA更能反映生物学表型形成原因。来源基因功能分析
生物体内,在特定条件下有的基因对应的转录本会形成环状RNA,Copyright@2011-2024 All Rights Reserved 版权所有:J9九游会 京ICP备15007085号-1