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三代微生物产品
1. 三代微生物
1.1 单菌组织样本(细菌,真菌)
1.2 三代扩增子组织样本
样本类型 | 建议送样量 | 最低送样量 |
---|---|---|
土壤/污泥/沉积物/腐殖质 | 3-5g | 1g |
水体滤膜 (孔径0.22-0.45μm/直径3-4cm) | 2-3张 | 1张 |
拭子 | 3-5个 | 1个 |
瘤胃液/发酵液/组织液 (离心有明显沉淀) | 3-5mL | 1mL |
粪便/肠道内容物 | 3-5g | 1g |
动物/人组织 | 1-3g | 1g |
血浆 | 3-5mL | 1mL |
项目类型 | 样本类型 |
---|---|
16s | 土壤、粪便、淤泥、人和动物组织样本、水体、酒糟(发酵液)、棉签拭子、瘤胃液、菌体 |
18s | 土壤、粪便、淤泥、水体、酒糟(发酵液)、藻类 |
ITS | 土壤、粪便、淤泥、沉积物、人和动物组织样本、水体、酒糟(发酵液) |
1.3 三代宏基因组组织样本
样本类型 | 建议送样量 | 最低送样量 |
---|---|---|
土壤/污泥/沉积物/腐殖质 | 6g | 2g |
水体滤膜 (孔径0.22-0.45μm/直径3-4cm) | 6张 | 2张 |
空气滤膜 (直径种类多,与采样器搭配,有明显颜色沉淀在滤膜上) | 6张 | 2张 |
拭子 | 10-20个 | 6个 |
瘤胃液/发酵液/组织液/冲洗液 (离心有明显沉淀) | 6-10mL,沉淀2g | 2mL,沉淀1g |
粪便/肠道内容物 | 5g | 2g |
动物/人组织 | 2g | 1g |
牛奶/酸奶 | 100mL/100g | 20mL/10g |
食糜 | 4g | 2g |
食品表面拭子 | 20个 | 10个 |
1.4 核酸样本(微生物)
1.4.1 单菌DNA送样量要求
(1)纯度要求:OD260/280=1.8~2.0,DNA 条带单一,无杂带,无 RNA、蛋白质等杂质污染; (2)样品浓度和总量要求:产品 | 送样量 |
---|---|
PB单菌 | 浓度≥70ng/μL,总量≥5μg |
ONT单菌 | 浓度≥60ng/μL,总量≥6μg |
1.4.2 三代扩增子DNA送样量要求?
1.4.2.1 DNA样本
(1)样品浓度:DNA≥10 ng/μL,总量:DNA≥150 ng;1.4.2.2 PCR样本(包cell)
(1)PCR产物浓度≥20 ng/μL,PCR 产物总量≥2μg(支持1次文库构建);1.4.3 三代宏基因组DNA送样量要求
(1)样品总量:DNA浓度 ≥80 ng/μL,DNA总量≥5 μg(nanopore平台)或 DNA总量≥10 μg(Pacbio平台);1.4.4 样本检测方法
(1) Invitrogen Qubit?Fluorometer1.4.5 样本检测使用量
样本类型 | Qubit? | AGE | Agilent 2100 | NanoDropTM/酶标仪 | 稀释度 |
---|---|---|---|---|---|
DNA样品 | 1-3μL | 100ng或5μL(低浓度样品) | 1.5-3μL | 1-2μL | 如样品浓度 >= 200ng/μL 将用TE缓冲液稀释原液 |
1.4.6 DNA样本质控说明
DNA样本质量图示。2 样本打包及寄送建议
2.1 样本的打包
(1)核酸样品建议使用质量好的1.5ml或2ml 低吸附EP管装载样品,并用封口膜封口。为了防止样品管破裂,或者污染和混乱,请不要使用诸如PCR管、0.5ml EP管、八联管、96孔板、深孔板等非标准管送样。非标准管不利于样品保存以及后续实验的进行。如有样品使用非标准管制备,还请在送样前自行转管处理。2.2 样本的名称标识
(1)所有的样品必须具有清晰的标记,并且简洁明了。Copyright@2011-2024 All Rights Reserved 版权所有:J9九游会 京ICP备15007085号-1