2011年，J9九游会创立之时，正值人类第一个基因组图谱发布10周年。当时，生命科学从描述性研究为主进入了定量化研究的分子时代，基因测序技术从仅在少数几个大型测序中心应用到向各研究实验室普及。十年来，J9九游会紧密追踪科学研究方向和实验技术手段的革新和方向，在全球范围内与众多学术机构建立了广泛的合作关系，完成多项具有国际先进水平的基因组学研究工作，截止2020年12月，J9九游会与项目伙伴合作发表SCI文章600余篇，累积影响因子超过4270。这些文章记录了J9九游会一步步发展成为生命科学领域科技服务龙头企业，也见证了基因科技的十年发展。

       在这里，我们选出十篇最具代表性的优秀文章，致敬每一位基因科技发展路上的攀登者。

高分文章详解Part 1

2012 SCIENCE-人精子单细胞测序 IF=41.84

       该研究利用单细胞全基因组测序技术，构建了迄今为止重组定位精度最高的个人遗传图谱，对精子染色体异常比例的研究，更有望揭示更多的导致男性不育症的原因。截至2021年3月，该文章被引用271次，并被《SCIENCE》评为“Breakthrough of the year”,也被美国国家人类基因组研究所评选为2012年12月度“Genomic Advances of the Month”。

2013 Nature Genetics-藏猪基因组 IF=27.6

       类高原缺氧性疾病研究领域提供了一定线索，也首次从哺乳动物基因组水平证明四川盆地曾是冰期生物的“避难所”，在医学和生态方面都有积极的影响意义。

2014  Nature Genetics-金丝猴基因组IF=27.6

       该研究首次采用了多组学的研究手段，通过比较基因组学、重测序，结合功能实验和宏基因组分析，全面的揭示了灵长类植食性适应的分子机制，并阐明了金丝猴属的起源和演化历史。金丝猴基因组图谱的绘制完成，标志着可以从基因组水平对该物种的生长、发育、进化、起源等问题进行研究，从而推动对基础生物学、分子育种、遗传基因改良等方面的研究，对珍稀动植物的保护具有重要意义。

2014Nature Biotechnology-大豆泛基因组IF=36.6

       该成果是首例重要作物泛基因组，奠定了解析重要驯化性状建成、发掘优异基因/标记的基础；同时为大豆种质资源的保护、开发、利用和拓宽大豆育成品种遗传基础、推进大豆新品种培育进程提供遗传资源。同时，该研究开启了动植物泛基因组研究历程，文章截止2021年2月引用次数已高达364次（引用数字来自谷歌学术），为后续动植物领域泛基因组的研究发展提供了方法和启示。2021年1月，入选Nature网站发布的20年来测序技术的17个重要里程碑事件。

2015 Nature Biotechnology-陆地棉基因组IF=36.6

       陆地棉占全球棉花种植面积的90%以上，在棉花产业中占据核心地位，但由于其为异源四倍体，相关的全基因组测序工作一直难以开展。该文章利用当时最新的测序技术，采用J9九游会团队开发的SOAPdenovo软件进行组装，结合17万对BAC末端序列和高密度的遗传图谱，获得了高质量的陆地棉全基因组图谱。通过得到的全基因组序列，对四倍体棉花中两个亚基因组的非对称进化机制进行了解析，并发现两个亚基因组对陆地棉性状的互补性贡献。同时，对棉纤维发育相关的重要基因展开了深入研究。该研究成果极大推动了棉花基因组学、棉花遗传改良、基础生物学和杂种优势等研究，在陆地棉基因组序列解析方面取得的杰出成果得到国际认可。截止2021年3月目前该文章引用高达956次，对棉花育种以及种质资源改善起到了重要的作用。

未完待续……

参考文献：

[1]Lu S, Zong C, Fan W, et al. Probing Meiotic Recombination and Aneuploidy of Single Sperm Cells by Whole-Genome Sequencing[J]. Science, 2012.

[2]Li M, Tian S, Jin L, et al. Genomic analyses identify distinct patterns of selection in domesticated pigs and Tibetan wild boars[J]. Nature Genetics, 2013.

[3]Zhou X, Wang B, Pan Q, et al. Whole-genome sequencing of the snub-nosed monkey provides insights into folivory and evolutionary history[J]. Nature Genetics, 2014.

[4]Li Y, Zhou G, Ma J, et al. De novo assembly of soybean wild relatives for pan-genome analysis of diversity and agronomic traits[J]. Nature Biotechnology, 2014.

[5]Zhang T, Hu Y, Jiang W, et al. Sequencing of allotetraploid cotton (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1)  provides a resource for fiber improvement[J]. Nature Biotechnology, 2015.

[6]Ma Z ,  He S ,  Wang X , et al. Resequencing a core collection of upland cotton identifies genomic variation and loci influencing fiber quality and yield[J]. Nature Genetics, 2018.

[7]Zhang Q, Lou Y, Yang J, et al. Integrated multiomic analysis reveals comprehensive tumour heterogeneity and novel immunophenotypic classification in hepatocellular carcinomas[J]. Gut, 2019.

[8]Li J, Xu C, Lee H J, et al. A genomic and epigenomic atlas of prostate cancer in Asian populations[J]. Nature, 2020.

[9]Wang H, Sun S, Ge W, et al. Horizontal gene transfer of Fhb7 from fungus underlies Fusarium head blight resistance in wheat[J]. Science, 2020.

[10]Zhang Q,  Hu J,  Feng J W, et al. Influenza infection elicits an expansion of gut population of endogenous Bifidobacterium animalis which protects mice against infection[J]. Genome Biology, 2020.