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RNA甲基化(MeRIP-seq)
1.细胞类样本
样本类型 | 常量建库 | 微量建库(只人、鼠) | 注意事项 |
---|---|---|---|
新鲜培养细胞 | ≥5*107 | ≥5*106 | 建议样品备份1-2份以防部分样品降解或RNA得率低导致总量不足。 |
细胞样本处理及运输方法: (1)细胞样本避免污染,贴壁细胞需充分消化,悬浮细胞和贴壁细胞需要进行一定的前处理; (2)前处理步骤:用PBS缓冲液(RNase-free)快速洗一次,加入1mlTrizol,用枪头反复抽打细胞,直至看不见成团的细胞块,整个溶液呈清亮而不粘稠的状态,液氮速冻,-80℃保存,干冰运输。 (3)送样前备注好物种、部位、保存时间。 |
2.组织类样本
样本类型 | 常量建库 | 微量建库(只人、鼠) | 注意事项 |
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新鲜动物组织 | ≥2g | ≥300mg | 组织类样本切记不可反复冻融,反复冻融样本不建议送样。 |
新鲜植物组织 | ≥5g | - | |
组织样本处理及运输方法: (1)取相应部位组织,尽量将组织切成1cm2左右的组织块; (2)将组织块放入旋盖冻存管中密封好,迅速置于液氮中速冻,-80℃保存,干冰运输。 (3)送样前备注好物种、部位、保存时间。 (4)皮肤、骨、结缔组织、脂肪等特殊组织建议送备份。 |
3.其他类型样本
样本类型 | 常量建库 | 微量建库(只人、鼠) | 注意事项 |
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自行提取RNA | ≥30μg(单次建库) | ≥2μg(单次建库) | - |
样本类型 | 送样量 | 注意事项 | |
自行送IP产物 | IP后产物,不需要公司去除rRNA,不需要公司打断片段 | IP 产物/Input样本送样量:单次建库大于20 ng,浓度大于1 ng/μl,插入片段大小分布建议在250-300 bp。 | 建议客户在IP过程中自行去除rRNA,且 IP后产物插入片段建议分布在250-300bp,J9九游会接收样品后会检测样品的总量和纯度,以J9九游会检测结果为准。 |
IP后产物,需要公司去除rRNA,不需要公司打断片段 | IP 产物/Input样本送样量:单次建库大于50 ng,浓度大于1 ng/μl,插入片段大小分布建议在250-300 bp。 | ||
IP后产物,需要公司去除rRNA,需要公司打断片段为250-300bp | IP 产物/Input样本送样量:单次建库大于50 ng,浓度大于1 ng/μl。 | ||
IP后产物,不需要公司去除rRNA,需要公司打断片段为250-300bp | IP 产物/Input样本送样量:单次建库大于20 ng,浓度大于1 ng/μl。 |
4.注意事项
(1)微量MeRIP只能做人、小鼠两类物种;5 样本打包及寄送建议
5.1 样本的打包
(1)核酸样品建议使用质量好的1.5ml或2ml 低吸附EP管装载样品,并用封口膜封口。为了防止样品管破裂,或者污染和混乱,请不要使用诸如PCR管、0.5ml EP管、八联管、96孔板、深孔板等非标准管送样。非标准管不利于样品保存以及后续实验的进行。如有样品使用非标准管制备,还请在送样前自行转管处理。5.2 样本的名称标识
(1)所有的样品必须具有清晰的标记,并且简洁明了。Copyright@2011-2024 All Rights Reserved 版权所有:J9九游会 京ICP备15007085号-1