基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
定量蛋白质组技术比较
iTRAQ和TMT是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术, 采用8种或18种同位素标签,通过特异性标记多肽的氨基酸基团, 一次上机可实现8种或18种不同样本中蛋白质的相对定量,是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。技术类型 | 是否标记 | 数据扫描模式 | 技术特点 |
---|---|---|---|
TMT | 是,多样本上机 | DDA | 定量准确,重复性好,不可比较有无蛋白,适用于同一物种同一组织共有蛋白差异比较,定量值存在压缩效应 |
iTRAQ | |||
Label-free | 否,多样本上机 | DDA | 适用范围广泛,成本较低,可用于“有无蛋白”比较,定量准确性和重复性不高 |
4D Label-free | 否,多样本上机 | DDA | 扫描速度快、灵敏度高,检测深度高,需求样本量少,可获取CCS |
DIA | 否,多样本上机 | DDA(建库) | 蛋白覆盖度高,定量准确,重现性高,适用于大样本,样本少时成本较高 |
否,单样本上机 | DIA | ||
4D DIA | 否,多样本上机 | DDA(建库) |
1. 近乎100%的离子利用率,提升检测灵敏度; 2.?更高的检测深度和覆盖度; 3. 定量重复性、完整性、可靠性全面提升。 |
否,单样本上机 | DIA | ||
Deep DIA(Astral) | 否,单样本上机 | DIA | 深覆盖、高准确、超快速,蛋白鉴定深度较传统定量技术提高了30%以上;机时更短,速度更快,周期更短;无损轨道分辨率更高。 |
高深度血液蛋白质组 | 否,单样本上机 | DIA | 针对不同物种的血液样本,可以达到更多样本检出 |
定量蛋白质组技术参数
产品 | 质谱平台 | 项目经验 | 周期 |
---|---|---|---|
TMT/iTRAQ |
Thermo Q ExactiveTM
HF-X/Orbitrap Exploris 480 |
蛋白鉴定数目6000以上 | 30个自然日 |
Label-free |
Thermo Q ExactiveTM
HF-X/Orbitrap Exploris 480 |
蛋白鉴定数目3000以上 | 30个自然日 |
4D Label-free | Bruker tims TOF Pro 2 | 蛋白鉴定数目6000以上 | 30个自然日 |
DIA |
Thermo Q ExactiveTM
HF-X/Orbitrap Exploris 480 |
蛋白鉴定数目6000以上 | 30个自然日 |
4D DIA | Bruker tims TOF Pro 2 | 蛋白鉴定数目6000以上 | 30个自然日 |
Deep DIA(Astral) | Orbitrap Astral | 蛋白鉴定数目10000以上 | 15个自然日 |
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