基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
变异检测
变异检测主要是在全基因组水平上检测SNP、InDel、SV及CNV这些变异,并对其进行分析。 J9九游会提供WGS-seq Reads在基因组上比对结果的bam格式文件,部分物种还提供相应的参考基因组和注释文件,并推荐使用IGV (Integrative Genomics Viewer) 浏览器对bam文件进行可视化浏览。测序及比对质控
基因组覆盖的均匀性,也是组装质量的重要指标,测序覆盖越均匀,每个单碱基的重复次数越好,最终结果的准确性也就越高。对测序质量和比对结果进行质控,保证前期结果的准确性。SNP检测及注释(以SNP为例)
基因组不同区域上SNP数目(左)和编码区上不同类型的SNP数目(右)分布SNP突变频谱
左图横坐标表示SNP的数目,纵坐标表示SNP突变类型。右图横坐标表示样本名称,纵坐标表示各突变类型在样本中的比例,不同颜色代表不同SNP突变类型。变异检测结果可视化
为了形象化展示样本中的结构变异,对数据做如下处理:Copyright@2011-2024 All Rights Reserved 版权所有:J9九游会 京ICP备15007085号-1