基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
数据质控
测序得到的原始测序序列(Sequenced Reads)或者 raw reads,里面含有带接头的、低质量的reads,为了保证信息分析质量,必须对raw reads过滤,得到clean reads,后续分析都基于clean reads。在测序过程中会存在一定的错误率,测序错误率分布检查可以反映测序数据的质量。参考序列比对
将比对到基因组上的reads分布情况进行统计,定位区域分为Exon(外显子)、基因表达水平分析
一个基因表达水平的直接体现就是其转录本的丰度情况,转录本丰度越高,则基因表达水平越高。我们通过所有基因的FPKM密度图以及小提琴图对不同实验条件下的基因表达水平进行比较,可以直观的获得不同实验条件下基因表达水平的情况。差异基因表达分析
用火山图可以直观展示不同实验条件下差异基因的分布情况。差异表达基因以火山图、韦恩图及聚类热图等丰富的形式展示样本间差异基因表达的情况。融合基因分析
融合基因可能会导致具有新的或不同功能的基因产物生成,这些异常活性的蛋白质会发挥癌基因的作用。此外,某些原癌基因还可能与一个新的启动子发生融合,从而激活下游癌基因的表达。差异基因GO富集分析
差异基因GO富集柱状图,直观的反映出在生物过程(biological process)、细胞组分(cellular component)Copyright@2011-2024 All Rights Reserved 版权所有:J9九游会 京ICP备15007085号-1